Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms