Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRMP28827 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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