Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 ACTBP12-201ENST00000435871 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AZI2-207ENST00000457172 1136 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC093821.1-201ENST00000503950 539 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 ZNF345-205ENST00000526123 458 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 C12orf73-203ENST00000546540 590 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 GLYCAM1-204ENST00000550226 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 MPHOSPH6-207ENST00000569021 392 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 RN7SL198P-201ENST00000583190 258 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 SCML2P1-201ENST00000584511 1100 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 LINC01515-207ENST00000598092 496 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 ZNF677-208ENST00000599012 796 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 CGA-202ENST00000610310 615 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LINC00587B1AMM8 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC117457.1-201ENST00000614557 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 KRTAP13-4-201ENST00000334068 797 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC012493.1-201ENST00000453252 760 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RN7SL107P-201ENST00000478127 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC099687.1-201ENST00000531798 510 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms