Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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