Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TRIM71Q2Q1W2 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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