Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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USP18Q9UMW8 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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