Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LMO3Q8TAP4 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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