Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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COL24A1Q17RW2 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
COL24A1Q17RW2 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
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