Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC027808.2-203ENST00000558261 638 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 CCL14-201ENST00000614009 3265 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 NCEH1-205ENST00000538775 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 STPG1-202ENST00000337248 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZNF774-202ENST00000379090 5613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 ARHGEF34P-201ENST00000483587 4532 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 ELF5-205ENST00000532417 2330 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 PIGN-201ENST00000357637 4723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 GOLGA2P5-202ENST00000304813 3105 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZNF239-201ENST00000306006 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 PRDX2P4-201ENST00000447134 600 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 SLC25A15P2-201ENST00000457292 338 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC113355.1-201ENST00000510512 491 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 SERPINB11-209ENST00000624518 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 SLC44A2-202ENST00000407327 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 PLXNA4-204ENST00000423507 3314 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 SORD2P-202ENST00000561384 2498 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 FMN1-207ENST00000559047 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AP001527.1-201ENST00000566440 1957 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 DACH2-208ENST00000613770 1731 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC005176.1-201ENST00000594263 1831 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRHP20396 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRHP20396 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRHP20396 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRHP20396 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRHP20396 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC037471.1-201ENST00000554586 1699 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC127381.2-201ENST00000560680 1699 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC138904.1-201ENST00000501520 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 LINC00662-201ENST00000561521 2480 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRHP20396 CLDN2-202ENST00000540876 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms