Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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USP35Q9P2H5 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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USP35Q9P2H5 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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USP35Q9P2H5 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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USP35Q9P2H5 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
USP35Q9P2H5 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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