Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDK4Q16654 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDK4Q16654 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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