Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TAAR8-201ENST00000275200 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 KIR2DL4-202ENST00000346587 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 METTL8P1-201ENST00000428182 611 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL26P34-201ENST00000431005 451 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC027607.1-201ENST00000503034 534 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC02385-201ENST00000547554 428 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC009090.1-201ENST00000562409 358 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL137802.2-201ENST00000562878 1110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms