Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL804P-201ENST00000582466 298 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL192P-201ENST00000584303 299 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00674-202ENST00000590734 160 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC111188.3-201ENST00000604663 307 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV18-201ENST00000390446 440 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINB8-204ENST00000397988 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008069.1-201ENST00000444710 950 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP66-201ENST00000494341 479 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IBA57-AS1-202ENST00000496552 594 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX293995.1-201ENST00000502880 755 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP31-201ENST00000509325 1014 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091951.4-201ENST00000512746 332 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018620.1-201ENST00000523233 379 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02455-201ENST00000541881 496 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006545.2-201ENST00000607091 461 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127381.3-201ENST00000622901 303 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012629.4-201ENST00000623327 259 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RWDD1-204ENST00000487832 1427 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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