Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC091885.2-201ENST00000510391 1791 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ARL17B-201ENST00000434041 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ARL17A-203ENST00000445552 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC00632-203ENST00000602535 723 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
IFFO1Q0D2I5 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL050402.1-201ENST00000440477 770 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC106799.2-201ENST00000507435 721 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC005176.1-203ENST00000597077 532 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
IFFO1Q0D2I5 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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