Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms