Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
IMPG1Q17R60 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms