Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 HNRNPA1P17-201ENST00000496620 924 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC087072.2-201ENST00000621060 682 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 LINC02470-201ENST00000412084 979 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GGTLC3B5MD39 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms