Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PPARGC1AQ9UBK2 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PPARGC1AQ9UBK2 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PPARGC1AQ9UBK2 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PPARGC1AQ9UBK2 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PPARGC1AQ9UBK2 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PPARGC1AQ9UBK2 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PPARGC1AQ9UBK2 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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