Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RNF17Q9BXT8 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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RNF17Q9BXT8 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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RNF17Q9BXT8 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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RNF17Q9BXT8 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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RNF17Q9BXT8 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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RNF17Q9BXT8 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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RNF17Q9BXT8 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
RNF17Q9BXT8 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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