Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HDAC11Q96DB2 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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