Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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TRAPPC6BQ86SZ2 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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