Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3HCC1Q9Y3T6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms