Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLEC4AQ9UMR7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLEC4AQ9UMR7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms