Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EHD3Q9NZN3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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