Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CWC25Q9NXE8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CWC25Q9NXE8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms