Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ASCL3Q9NQ33 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms