Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB9BQ9NP90 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB9BQ9NP90 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms