Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPJQ9HC77 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms