Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms