Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms