Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC5LQ99459 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms