Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YTHDC1Q96MU7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YTHDC1Q96MU7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms