Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC17Q96LX7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms