Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC1Q96C34 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC1Q96C34 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms