Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FAT3Q8TDW7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FAT3Q8TDW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms