Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms