Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR49Q8IV35 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms