Protein–RNA interactions for Protein: Q63HN8

RNF213, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, humanhuman

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Length 5,207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF213Q63HN8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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RNF213Q63HN8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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RNF213Q63HN8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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RNF213Q63HN8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF213Q63HN8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF213Q63HN8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF213Q63HN8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF213Q63HN8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF213Q63HN8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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