Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP188Q5SRE5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms