Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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