Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME3Q13232 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME3Q13232 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NME3Q13232 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NME3Q13232 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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NME3Q13232 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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NME3Q13232 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME3Q13232 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME3Q13232 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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