Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMA1Q12791 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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