Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CABP4P57796 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CABP4P57796 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CABP4P57796 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CABP4P57796 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CABP4P57796 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CABP4P57796 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms