Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA4P52798 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA4P52798 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms