Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms