Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AP000962.2-201ENST00000624971 1101 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC008543.2-201ENST00000436907 1383 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL513123.1-201ENST00000415883 597 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD11P31277 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms