Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA11P31270 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA11P31270 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms