Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMNB1P20700 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms