Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MS4A1P11836 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms