Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RD3LP0DJH9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms